故事開始於一處名為「雙葉鎮」的地方。
「就算我們分隔異地，我們的友情都會不變的！」男孩拿出一顆精靈球，並使力的將其一分為二，把當中紅色的部分交給女孩後，續說：「這就是我們間友情的證明。終有一日我們都會成為精靈訓練員的吧，要是在旅程中重遇對方，即使就不起對方的樣子，也可以認回這精靈球。」
「那時候我們一定要成為比現在更要好的拍擋哩。」女孩說罷，便擦去自己的眼淚，笑著告別：「再見了，草王……」
「再見哩，小美……」男孩說罷，便流出了那忍了很久的眼淚，目送著火車起行、離去……
於是，男孩在雙葉鎮過活了五年，迎來十歲生日的這一天。
在這個世界，每名小孩年滿十歲便可以得到其第一隻寵物小精靈，開始他與寵物小精靈的冒險旅程。
不過，在這片充滿著變化氣息的大地之中，男孩又對過去的事記得多少？
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第 01 話「雙葉鎮．冒險開始」
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精靈紀．2008 年 9 月 16 日上午 7 時
＊ 9 月 16 日其實是作者生日日期 ww
「菊草葉！向耿鬼用“撞擊”吧！」男孩說罷，菊草葉便十分聽話的向耿鬼撞過去。耿鬼被菊草葉碰到後，便應聲彈至幾十米之外，重傷倒地。
「是時候了！暗黑球，去把耿鬼收服過來吧！」說罷，男孩便投出了一顆深綠色、帶黑色網狀花紋的精靈球往耿鬼，並將其收進球來。按著，精靈球便開始晃動……
「拜託了！那可是我最後一顆精靈球……」男孩話未說完，精靈球便像聽到他的話似的……應該被耿鬼逃脫出來……
「喵的（喂你好像只有十歲而已？）！這豈不是白費心機了！」說把，男孩便向眼前的耿鬼踢了一腳。
「耿鬼！」耿鬼受踢後便立即黑起面來（其實是全身黑了起來吧，牠的身體根本是一張臉……），然後變大、變大，還變型，更傳出音樂了！
「這莫非是傳說中的“時空進化”？不是嘛，那種東西只是在《數碼暴龍》出的吧？現在竟然親眼看見了！三生有幸！」男孩還不知死的解說著，可是那頭巨大怪物早就瞄準了男孩，發射“破壞光束”了。
「嗚哇，好討厭啊！！！」
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醒過來了，男孩從睡夢中醒過來。
「嗯……是夢吧？」男孩捽了捽眼睛，睜大眼看了看鬧鐘，打著嗑睡說：「原來已經八時了哩……雖說約了博士於九時會面，不過不要緊吧……」
「你還想睡到何時啊笨老哥！」接著便有另一名大力的推開了男孩的房門，叫道：「你忘了今天是什麼日子嗎？」
「今天？好像是誰的 CD 的發售日吧？不要緊我借錢給你，所以別吵了，求求你～～」哥哥回答說。
「啊啦？天天吵沒零用錢，原來是拿來給小特亂花錢了吧……給我滾起床！草王！」站在妹妹旁邊的女人這一大喝，哥哥大叫了一聲「媽媽？」後便立即跳了起床，肅立著且動也不敢動。
「快給我去刷牙換衣服！」說罷，草王便像火箭似的衝往廁所去。
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「媽，老哥剛才告訴我他發了一個很有趣的夢哩。」小特邊把餐碟上的煙肉填進肚子，邊說：「哥說他夢見自己正打算收服“野生”的耿鬼，命令了自己初從博士得到的“菊草葉”向牠發動了“撞擊”，並把牠擊倒了。正當快成功收服牠之際，耿鬼竟然……」
「草王！」母親未聽畢，便轉頭往草王處破口大罵：「你究竟有沒有讀過區時博士給你的那本《口袋中的奇蹟》啊？再不然也到區時博士的網站《區時的寵物小精靈》看看吧！世界上可沒有野生的耿鬼！普通系的“撞擊”對耿鬼根本沒效！而且待會兒區時博士給你選的寵物小精靈就只有樹苗龜、小火猴和圓企鵝選，菊草葉已經是上個世紀的玩意了！」
＊區時 -> Aucy ，據說曾跟作者共同開發過網路遊戲？
＊《口袋中的奇蹟》 -> 香港區寵物小精靈同人本系列《Pokemon Miracle》，由 PokeDream 製作，至本文刊登日已經出至第七本，作者亦有參與製作
＊《區時的寵物小精靈》 -> Aucy’s Pokemon ，香港網上著名寵物小精靈資料庫
「不！菊草葉是於 2002 年 11 月 21 日才停止發放的，不算是上個世紀！而且先代的奇異種子、小火龍和車厘龜，於 2004 年 1 月 29 日至 9 月 15 日期間也有重新發放過，你憑什麼否定由今天起可能重新發放菊草葉的可能性呢！」草王雙眼發光的發表自己解說，卻換不來媽媽和妹妹的冷目，還被妹妹反嘲：「放心吧，寵物小精靈聯盟會等你掛掉後發放菊草葉，記念你這位菊草葉控的了。」
＊ 2002 年 11 月 21 日，日本於當日開售電子遊戲《寵物小精靈紅寶石》和《寵物小精靈藍寶石》
＊ 2004 年 1 月 29 日，日本於當日開售電子遊戲《寵物小精靈火紅》和《寵物小精靈葉綠》
＊ 2004 年 9 月 16 日，日本於當日開售電子遊戲《寵物小精靈綠寶石》
「難道你不覺得菊草葉很可愛嗎？比起那些笨企鵝、悟空大聖，菊草葉的作畫簡單得多了！簡單就是美，你不明白嗎？」
＊笨企鵝 -> 圓企鵝、悟空大聖 -> 小火猴…
「其實是你太過笨手笨腳，只會畫菊草葉而已吧。對了媽媽，去年考試老哥的美術成績好像是不……」
「住口！」草王沒讓小特說下去，並快快的按著她的口，說：「好了好了，我也差不多要到研究所去了！待會兒還要參加寵物小精靈的對戰訓練，今晚回來再說吧！」
＊按作者憶述，他於香港中學會考的美術科成績是 E 的
說罷，草王便穿著他那對沾滿污跡的球鞋，往門外跑去了。
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「等了你很久了！新人乙！」在通往博士研究所的路上，草王遇到了一位女孩，對他問好說：「很久沒見了哩，草王。身體還好嗎？」
然而草王卻完全記不起她，「初次見面……不，你說我們早就見過面嗎？在哪裡？」
「是我啊！……似乎你記不起我的樣子，那你應該記得這半顆精靈球吧？」說罷，小美便拿出那時候草王交給她作留念的半顆精靈球，說：「都已經五年了，這五年來我也有好好的保存著這半顆精靈球的哩。」
「抱歉，不過……」草王拿起小美的那半顆精靈球，說：「五年前的事我忘記得一乾二淨了……」
就在小美聽到其失憶的消息發呆之際，歐時博士的聲音便隨即傳來，「呃……對不起我遲了點。」，草王亦叫了一聲：「公公！」
＊在現實中區時亦很多時被戲稱為「公公」（太監）
「不要這樣稱呼我！現在在別人面前就稱回我作博士好了！」歐時博士大聲的向草王責備後，便拿出了一個皮箱，說：「你們的寵物小精靈就在這裡。你們應該有到過我的網站瀏覽過這些精靈的資料吧。樹苗龜、小火猴和圓企鵝，都是攻擊力防守力兼備、且配招全面的寵物小精靈。現在就按照自己的意願，選擇其中一隻……吧……」
其實還沒等區時博士說完，草王已經從皮箱中取去放在最左手邊的精靈球，說：「樹苗龜在運用層面上跟菊草葉差不多吧，決定用你好了！」
「你還是老樣子的喜歡菊草葉哩，草王……」小美的評語，對草王來說似乎只是閒話，「那我也決定了，就用你吧，小火猴。」
「小火猴嗎？以歷代的初學者小精靈來說，我還是覺得火球鼠比較強。可惜的是精靈聯盟那邊卻完全沒有發配那年代的的初學者小精靈的打算哩……」草王說罷，便再次呆看著那顆載著樹苗龜的精靈球，「要是你可以變身為菊草葉就好了！」
「別這樣吧，樹苗龜他會不開心的哩。對了，博士……」接著小美便走到博士身邊，伸高在耳邊問：「明明他還是很喜歡菊草葉的，為什麼……」
「我也不清楚哩，好像說是五年前的今天開始便失憶的了……說起來，你要是知道些什麼的話，可以告訴我們這些大人嗎？畢竟我們不是太明白小孩子怎樣想，特別是五年前的草王……」
「五年前嗎？……對了，五年前的今天，正是我乘火車離雙葉鎮的那時候……」小美轉頭凝視著那位曾經是青梅足馬，現在卻變得十分陌生的朋友，冷冷說道：「究竟那一天發生了什麼事呢？」
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「這裡是神事湖，也就是今天進行對戰訓練的地方了。不過哩，……」說著，區時博士便看了看自己的手錶，說：「不過這個下午正好遇著有關箱庭諸島的精靈研究發佈會……你們兩個就自行訓練一會兒，初嘗一下精靈訓練員的生活吧。完成訓練後，還是先回家跟家人商討一下以後的去向吧。別忘記，在這個世不是每個小孩一到 10 歲生日那天、得到第一隻寵物小精靈後，便一定要展開冒險旅程的。」
說罷，博士便向小美眨了眨眼，然後便離開神事湖畔。
「博士他很奇怪哩，好像看見你後便收得不知怎樣應對了。」說到一半，草王便張起他那副奸笑臉，問：「究竟小美你對博士做過什麼不可告人的秘密呢？」
小美聽見草王道出她的名字，感覺十分驚奇，「我可不曾記得向你自我介紹過哩……真正有不可告人的秘密的人……是你吧？」
「……別說這些無關痛癢的事吧！博士叫我們來作訓練的，那就開始訓練吧！」接著，草王便把精靈球拋出，把剛獲得的樹苗龜釋出來……咦？樹苗龜？
「菊草！」跑出來的是一頭菊草葉，還令草王和小美看得目瞪口呆。
「呃？我不是在發夢吧？」草王說罷，便被小美應聲掌了一耳光，問道：「你覺得呢？」
草王摸了摸那記得臉紅的臉頰，大叫一聲：「不是！是真的！」後便一下子的撲向菊草葉，抱著牠擠在懷裡說：「是菊草葉哩！ My dream Pokemon ！」
「那時候的你告訴過我無數次，長大後一定要選菊草葉作拍擋的……現在算是如願以償吧！」小美笑說。
「對哩……呃……五年前的我有這樣說過嗎？哈哈。」草王那牽強的笑容，更為引起小美的懷疑，「我們開始對戰吧！」
「拜託你了，小火猴！」小美擲出精靈球，把剛到手的小火猴釋放出來，亦代表他們的第一場小精靈戰鬥正式開始。不過……
「艾姆……」一道不知來何方的聲音，響遍了整個神事湖畔。接著，便有一服強風從湖中央的小島吹來，一下子把草王吹倒地上；而強風最後則吹至站在湖畔入口的一個男人身上。
那人長著藻藍色的短髮，跟草王的翠綠色頭髮十分相似。他身上穿著一套銀灰色長袍，胸還印有一個黃色的 G 字。他就站在遠處看著草王，並問道：「沒事嗎？」
「沒事。」草王輕聲的回答並站起來，卻連眼角也不瞧他一下。
「生日快樂哩，那隻菊草葉正是我送給你的生日禮物。開心嗎？」那男人問道。
「雖然不知道閣下是何方神聖，亦不清楚閣下的用意何在……不過既然你送給我的小精靈，可是我最喜歡的菊草葉，那我得向閣下致謝一下。」說罷，草王便鄭重的向那男人鞠了一個躬，期間還是沒有看過對方一下。
「……不用謝。」那男人說罷，便對他旁邊的小美問好：「可以幫我照顧他嗎？終有一日我一定會帶他到新世界的……」最後，那男人沒留下半句道別的話，便離開了神事湖畔。
小美沒法摸清楚發生了什麼事，只好問草王：「這傢伙……是誰？」
「你真的想知道五年前發生了什麼嗎？……」
草王終於打開了他的心扉，向那位並非陌生而是十分熟悉的朋友打開了心扉。
似乎，五年前的那段沒人知曉的秘密，跟這個陌生男子有關……
TO BE CONTINUED…
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草王：各位好～～！！又到了久違的預告時間了！！！
小美：什麼久違？不是才剛開始第一話嗎？
草王：差點忘了！對了大家，新一輯的《草王歷險記》是完全無視以前的設定的，
所以大家可以放下五年以來對本小說的所有記憶，重來一遍了！
小美：你叫重來三百多話一遍的話，我真的會死給你看的……
次回 草王歷險記
「真砂市．精靈圖鑑 GET ！」
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「五年前……竟然發生了這樣的一件事……」小美聽見後亦目瞪口呆，對草王所說的事難以置信……
「不過你可以替我保密嗎？」草王從口袋中拿出了半顆精靈球，「看，我可沒忘記過那時候的約定的……剛才假裝不認識你，是我的錯。」
「不啦，我早就察覺得到你在說謊了。」小美亦把另外半顆精靈球放在草王手上，並撲在草王胸前哭道：「不過……可以讓我把五年前的那場未完的哭，哭完去嗎？」
「嗯，因為在旅程上我不會再讓你哭的了。」草王說著，便把那精靈球再次合二為一，「現在就去實現我們的共同夢想吧－－要成為世上最強的訓練員拍擋哩。」
不過，現在離你們的目標，還有多少路要走呢？
